1.有些代理记账公司没有与托付单位签订正式的托付代理合同，对两头的权力、责任短少清晰的规定，在实践工作中遇到贰言时，往往无法辨明责任。因此在挑选代账公司的时候，企业就要愈加稳重。
2.单个 “代理记账公司”没有代理记账资质（市财政局赞同的代理记账许可证、会计上岗证等），发生问题可以逃避责任，损害托付单位的利益。这也是小企业在挑选代账服务公司时有必要要注意的事项。
3. 财务软件需要到财政局备案方可运用，有的代理记账单位没有选用财政部赞同的财务软件来替代手工记账。
4.会计资料交代麻烦、不够标准。代理记账单位在承受托付单位的会计原始凭证及资料时，没有处理交代手续，发现丢失或毁损时无法查找。
5.代理记账单位通常是定时或守时上门服务，日常业务可通过电话交流，会计不是随时在单位处理和咨询业务
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